Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms