Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC6Q16204 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
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