Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GRIK4Q16099 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
GRIK4Q16099 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
GRIK4Q16099 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
GRIK4Q16099 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
GRIK4Q16099 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
GRIK4Q16099 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
GRIK4Q16099 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
GRIK4Q16099 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GRIK4Q16099 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
GRIK4Q16099 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
GRIK4Q16099 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
GRIK4Q16099 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
GRIK4Q16099 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
GRIK4Q16099 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
GRIK4Q16099 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
GRIK4Q16099 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
GRIK4Q16099 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GRIK4Q16099 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
GRIK4Q16099 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GRIK4Q16099 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
GRIK4Q16099 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GRIK4Q16099 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GRIK4Q16099 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GRIK4Q16099 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GRIK4Q16099 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GRIK4Q16099 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
GRIK4Q16099 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GRIK4Q16099 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GRIK4Q16099 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GRIK4Q16099 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GRIK4Q16099 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GRIK4Q16099 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
GRIK4Q16099 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GRIK4Q16099 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GRIK4Q16099 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GRIK4Q16099 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GRIK4Q16099 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
GRIK4Q16099 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
GRIK4Q16099 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GRIK4Q16099 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GRIK4Q16099 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GRIK4Q16099 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GRIK4Q16099 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GRIK4Q16099 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GRIK4Q16099 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GRIK4Q16099 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GRIK4Q16099 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GRIK4Q16099 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GRIK4Q16099 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GRIK4Q16099 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GRIK4Q16099 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GRIK4Q16099 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GRIK4Q16099 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GRIK4Q16099 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GRIK4Q16099 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GRIK4Q16099 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
GRIK4Q16099 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
GRIK4Q16099 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
GRIK4Q16099 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
GRIK4Q16099 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GRIK4Q16099 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
GRIK4Q16099 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GRIK4Q16099 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
GRIK4Q16099 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
GRIK4Q16099 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GRIK4Q16099 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
GRIK4Q16099 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
GRIK4Q16099 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GRIK4Q16099 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
GRIK4Q16099 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GRIK4Q16099 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GRIK4Q16099 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
GRIK4Q16099 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
GRIK4Q16099 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GRIK4Q16099 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GRIK4Q16099 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
GRIK4Q16099 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
GRIK4Q16099 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
GRIK4Q16099 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GRIK4Q16099 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GRIK4Q16099 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GRIK4Q16099 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GRIK4Q16099 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GRIK4Q16099 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GRIK4Q16099 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GRIK4Q16099 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GRIK4Q16099 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
GRIK4Q16099 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GRIK4Q16099 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GRIK4Q16099 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GRIK4Q16099 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GRIK4Q16099 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
GRIK4Q16099 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GRIK4Q16099 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GRIK4Q16099 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GRIK4Q16099 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GRIK4Q16099 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
GRIK4Q16099 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GRIK4Q16099 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
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