Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
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