Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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CDSNQ15517 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDSNQ15517 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDSNQ15517 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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