Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PUM3Q15397 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PUM3Q15397 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PUM3Q15397 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PUM3Q15397 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PUM3Q15397 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PUM3Q15397 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PUM3Q15397 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PUM3Q15397 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PUM3Q15397 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
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