Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
NECTIN1Q15223 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NECTIN1Q15223 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NECTIN1Q15223 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NECTIN1Q15223 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NECTIN1Q15223 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NECTIN1Q15223 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NECTIN1Q15223 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NECTIN1Q15223 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NECTIN1Q15223 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NECTIN1Q15223 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NECTIN1Q15223 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NECTIN1Q15223 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NECTIN1Q15223 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NECTIN1Q15223 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NECTIN1Q15223 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
NECTIN1Q15223 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NECTIN1Q15223 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NECTIN1Q15223 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NECTIN1Q15223 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NECTIN1Q15223 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NECTIN1Q15223 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NECTIN1Q15223 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NECTIN1Q15223 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NECTIN1Q15223 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NECTIN1Q15223 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NECTIN1Q15223 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NECTIN1Q15223 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NECTIN1Q15223 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
NECTIN1Q15223 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NECTIN1Q15223 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NECTIN1Q15223 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NECTIN1Q15223 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NECTIN1Q15223 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NECTIN1Q15223 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NECTIN1Q15223 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
NECTIN1Q15223 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NECTIN1Q15223 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NECTIN1Q15223 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NECTIN1Q15223 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NECTIN1Q15223 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NECTIN1Q15223 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NECTIN1Q15223 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NECTIN1Q15223 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NECTIN1Q15223 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NECTIN1Q15223 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NECTIN1Q15223 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NECTIN1Q15223 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NECTIN1Q15223 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NECTIN1Q15223 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NECTIN1Q15223 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NECTIN1Q15223 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NECTIN1Q15223 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NECTIN1Q15223 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NECTIN1Q15223 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NECTIN1Q15223 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
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NECTIN1Q15223 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NECTIN1Q15223 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NECTIN1Q15223 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
NECTIN1Q15223 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NECTIN1Q15223 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NECTIN1Q15223 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NECTIN1Q15223 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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NECTIN1Q15223 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NECTIN1Q15223 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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NECTIN1Q15223 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NECTIN1Q15223 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NECTIN1Q15223 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
NECTIN1Q15223 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NECTIN1Q15223 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NECTIN1Q15223 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NECTIN1Q15223 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NECTIN1Q15223 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NECTIN1Q15223 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NECTIN1Q15223 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NECTIN1Q15223 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NECTIN1Q15223 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NECTIN1Q15223 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NECTIN1Q15223 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NECTIN1Q15223 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NECTIN1Q15223 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
NECTIN1Q15223 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
NECTIN1Q15223 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
NECTIN1Q15223 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NECTIN1Q15223 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NECTIN1Q15223 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NECTIN1Q15223 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NECTIN1Q15223 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NECTIN1Q15223 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
NECTIN1Q15223 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NECTIN1Q15223 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
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