Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDCD1Q15116 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms