Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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