Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
R3HDM1Q15032 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
R3HDM1Q15032 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
R3HDM1Q15032 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
R3HDM1Q15032 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
R3HDM1Q15032 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
R3HDM1Q15032 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
R3HDM1Q15032 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
R3HDM1Q15032 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
R3HDM1Q15032 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
R3HDM1Q15032 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
R3HDM1Q15032 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
R3HDM1Q15032 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
R3HDM1Q15032 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
R3HDM1Q15032 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
R3HDM1Q15032 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
R3HDM1Q15032 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
R3HDM1Q15032 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
R3HDM1Q15032 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
R3HDM1Q15032 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
R3HDM1Q15032 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
R3HDM1Q15032 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
R3HDM1Q15032 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
R3HDM1Q15032 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
R3HDM1Q15032 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
R3HDM1Q15032 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
R3HDM1Q15032 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
R3HDM1Q15032 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
R3HDM1Q15032 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
R3HDM1Q15032 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
R3HDM1Q15032 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
R3HDM1Q15032 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
R3HDM1Q15032 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
R3HDM1Q15032 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
R3HDM1Q15032 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
R3HDM1Q15032 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
R3HDM1Q15032 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
R3HDM1Q15032 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
R3HDM1Q15032 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
R3HDM1Q15032 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
R3HDM1Q15032 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
R3HDM1Q15032 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
R3HDM1Q15032 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
R3HDM1Q15032 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
R3HDM1Q15032 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
R3HDM1Q15032 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
R3HDM1Q15032 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
R3HDM1Q15032 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
R3HDM1Q15032 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
R3HDM1Q15032 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
R3HDM1Q15032 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
R3HDM1Q15032 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
R3HDM1Q15032 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
R3HDM1Q15032 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
R3HDM1Q15032 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
R3HDM1Q15032 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
R3HDM1Q15032 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
R3HDM1Q15032 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
R3HDM1Q15032 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
R3HDM1Q15032 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
R3HDM1Q15032 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
R3HDM1Q15032 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
R3HDM1Q15032 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
R3HDM1Q15032 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
R3HDM1Q15032 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
R3HDM1Q15032 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
R3HDM1Q15032 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
R3HDM1Q15032 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
R3HDM1Q15032 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
R3HDM1Q15032 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
R3HDM1Q15032 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
R3HDM1Q15032 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
R3HDM1Q15032 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
R3HDM1Q15032 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
R3HDM1Q15032 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
R3HDM1Q15032 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
R3HDM1Q15032 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
R3HDM1Q15032 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
R3HDM1Q15032 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
R3HDM1Q15032 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
R3HDM1Q15032 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
R3HDM1Q15032 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
R3HDM1Q15032 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
R3HDM1Q15032 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
R3HDM1Q15032 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
R3HDM1Q15032 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
R3HDM1Q15032 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
R3HDM1Q15032 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
R3HDM1Q15032 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
R3HDM1Q15032 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
R3HDM1Q15032 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
R3HDM1Q15032 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
R3HDM1Q15032 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
R3HDM1Q15032 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
R3HDM1Q15032 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
R3HDM1Q15032 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
R3HDM1Q15032 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
R3HDM1Q15032 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
R3HDM1Q15032 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
R3HDM1Q15032 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
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