Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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HERPUD1Q15011 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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HERPUD1Q15011 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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HERPUD1Q15011 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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HERPUD1Q15011 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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HERPUD1Q15011 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERPUD1Q15011 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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HERPUD1Q15011 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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HERPUD1Q15011 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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HERPUD1Q15011 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HERPUD1Q15011 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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