Protein–RNA interactions for Protein: Q14997

PSME4, Proteasome activator complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,843 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME4Q14997 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSME4Q14997 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSME4Q14997 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSME4Q14997 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSME4Q14997 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSME4Q14997 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSME4Q14997 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSME4Q14997 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PSME4Q14997 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSME4Q14997 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSME4Q14997 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSME4Q14997 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSME4Q14997 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSME4Q14997 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSME4Q14997 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSME4Q14997 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSME4Q14997 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSME4Q14997 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PSME4Q14997 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSME4Q14997 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSME4Q14997 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSME4Q14997 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSME4Q14997 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSME4Q14997 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSME4Q14997 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PSME4Q14997 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PSME4Q14997 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSME4Q14997 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PSME4Q14997 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PSME4Q14997 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSME4Q14997 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSME4Q14997 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSME4Q14997 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSME4Q14997 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSME4Q14997 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSME4Q14997 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSME4Q14997 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSME4Q14997 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSME4Q14997 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSME4Q14997 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSME4Q14997 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSME4Q14997 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSME4Q14997 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSME4Q14997 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSME4Q14997 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSME4Q14997 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
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PSME4Q14997 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSME4Q14997 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSME4Q14997 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PSME4Q14997 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PSME4Q14997 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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PSME4Q14997 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PSME4Q14997 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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PSME4Q14997 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PSME4Q14997 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PSME4Q14997 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PSME4Q14997 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PSME4Q14997 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PSME4Q14997 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PSME4Q14997 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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PSME4Q14997 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PSME4Q14997 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PSME4Q14997 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PSME4Q14997 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PSME4Q14997 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PSME4Q14997 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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PSME4Q14997 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PSME4Q14997 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PSME4Q14997 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PSME4Q14997 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PSME4Q14997 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PSME4Q14997 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PSME4Q14997 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PSME4Q14997 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PSME4Q14997 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PSME4Q14997 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PSME4Q14997 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PSME4Q14997 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PSME4Q14997 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PSME4Q14997 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PSME4Q14997 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PSME4Q14997 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PSME4Q14997 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PSME4Q14997 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PSME4Q14997 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PSME4Q14997 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PSME4Q14997 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PSME4Q14997 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PSME4Q14997 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PSME4Q14997 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PSME4Q14997 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PSME4Q14997 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
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