Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RFTN1Q14699 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
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