Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
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