Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IRF5Q13568 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IRF5Q13568 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IRF5Q13568 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IRF5Q13568 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IRF5Q13568 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
IRF5Q13568 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
IRF5Q13568 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
IRF5Q13568 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IRF5Q13568 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
IRF5Q13568 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
IRF5Q13568 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
IRF5Q13568 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
IRF5Q13568 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
IRF5Q13568 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
IRF5Q13568 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IRF5Q13568 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IRF5Q13568 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IRF5Q13568 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IRF5Q13568 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IRF5Q13568 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
IRF5Q13568 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IRF5Q13568 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
IRF5Q13568 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
IRF5Q13568 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
IRF5Q13568 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
IRF5Q13568 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IRF5Q13568 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IRF5Q13568 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IRF5Q13568 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
IRF5Q13568 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IRF5Q13568 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
IRF5Q13568 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
IRF5Q13568 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
IRF5Q13568 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
IRF5Q13568 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
IRF5Q13568 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IRF5Q13568 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IRF5Q13568 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IRF5Q13568 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
IRF5Q13568 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
IRF5Q13568 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
IRF5Q13568 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
IRF5Q13568 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
IRF5Q13568 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
IRF5Q13568 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
IRF5Q13568 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
IRF5Q13568 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
IRF5Q13568 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
IRF5Q13568 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
IRF5Q13568 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IRF5Q13568 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IRF5Q13568 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IRF5Q13568 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IRF5Q13568 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
IRF5Q13568 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IRF5Q13568 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
IRF5Q13568 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
IRF5Q13568 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
IRF5Q13568 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
IRF5Q13568 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
IRF5Q13568 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
IRF5Q13568 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
IRF5Q13568 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
IRF5Q13568 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
IRF5Q13568 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
IRF5Q13568 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
IRF5Q13568 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
IRF5Q13568 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
IRF5Q13568 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
IRF5Q13568 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
IRF5Q13568 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
IRF5Q13568 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
IRF5Q13568 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
IRF5Q13568 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
IRF5Q13568 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
IRF5Q13568 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
IRF5Q13568 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
IRF5Q13568 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
IRF5Q13568 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
IRF5Q13568 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
IRF5Q13568 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
IRF5Q13568 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
IRF5Q13568 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
IRF5Q13568 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
IRF5Q13568 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
IRF5Q13568 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
IRF5Q13568 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
IRF5Q13568 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
IRF5Q13568 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
IRF5Q13568 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
IRF5Q13568 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
IRF5Q13568 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
IRF5Q13568 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
IRF5Q13568 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
IRF5Q13568 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
IRF5Q13568 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
IRF5Q13568 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
IRF5Q13568 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
IRF5Q13568 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms