Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MKRN4PQ13434 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MKRN4PQ13434 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MKRN4PQ13434 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MKRN4PQ13434 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MKRN4PQ13434 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MKRN4PQ13434 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MKRN4PQ13434 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MKRN4PQ13434 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MKRN4PQ13434 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MKRN4PQ13434 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MKRN4PQ13434 AC240504.1-201ENST00000395709 845 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
MKRN4PQ13434 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MKRN4PQ13434 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
MKRN4PQ13434 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
MKRN4PQ13434 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MKRN4PQ13434 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MKRN4PQ13434 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MKRN4PQ13434 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MKRN4PQ13434 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MKRN4PQ13434 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MKRN4PQ13434 SYNJ2BP-COX16-205ENST00000621525 929 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MKRN4PQ13434 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MKRN4PQ13434 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MKRN4PQ13434 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MKRN4PQ13434 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MKRN4PQ13434 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MKRN4PQ13434 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MKRN4PQ13434 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MKRN4PQ13434 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MKRN4PQ13434 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MKRN4PQ13434 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MKRN4PQ13434 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MKRN4PQ13434 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MKRN4PQ13434 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MKRN4PQ13434 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MKRN4PQ13434 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MKRN4PQ13434 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MKRN4PQ13434 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MKRN4PQ13434 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MKRN4PQ13434 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MKRN4PQ13434 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MKRN4PQ13434 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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MKRN4PQ13434 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MKRN4PQ13434 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MKRN4PQ13434 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MKRN4PQ13434 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MKRN4PQ13434 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MKRN4PQ13434 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MKRN4PQ13434 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MKRN4PQ13434 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MKRN4PQ13434 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MKRN4PQ13434 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MKRN4PQ13434 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MKRN4PQ13434 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MKRN4PQ13434 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MKRN4PQ13434 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MKRN4PQ13434 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MKRN4PQ13434 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MKRN4PQ13434 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MKRN4PQ13434 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MKRN4PQ13434 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
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MKRN4PQ13434 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
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MKRN4PQ13434 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MKRN4PQ13434 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
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MKRN4PQ13434 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
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MKRN4PQ13434 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
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MKRN4PQ13434 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MKRN4PQ13434 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MKRN4PQ13434 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
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MKRN4PQ13434 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MKRN4PQ13434 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MKRN4PQ13434 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MKRN4PQ13434 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MKRN4PQ13434 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MKRN4PQ13434 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MKRN4PQ13434 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MKRN4PQ13434 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MKRN4PQ13434 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MKRN4PQ13434 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MKRN4PQ13434 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MKRN4PQ13434 LINC01477-201ENST00000566101 1226 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MKRN4PQ13434 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MKRN4PQ13434 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MKRN4PQ13434 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MKRN4PQ13434 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
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