Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SRSF5Q13243 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SRSF5Q13243 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SRSF5Q13243 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SRSF5Q13243 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SRSF5Q13243 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SRSF5Q13243 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SRSF5Q13243 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SRSF5Q13243 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SRSF5Q13243 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SRSF5Q13243 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SRSF5Q13243 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SRSF5Q13243 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SRSF5Q13243 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SRSF5Q13243 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SRSF5Q13243 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SRSF5Q13243 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SRSF5Q13243 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SRSF5Q13243 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SRSF5Q13243 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms