Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.74
STRN3Q13033 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
STRN3Q13033 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
STRN3Q13033 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
STRN3Q13033 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
STRN3Q13033 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
STRN3Q13033 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
STRN3Q13033 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
STRN3Q13033 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
STRN3Q13033 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
STRN3Q13033 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
STRN3Q13033 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
STRN3Q13033 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
STRN3Q13033 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
STRN3Q13033 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
STRN3Q13033 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
STRN3Q13033 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
STRN3Q13033 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
STRN3Q13033 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
STRN3Q13033 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
STRN3Q13033 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
STRN3Q13033 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
STRN3Q13033 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
STRN3Q13033 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
STRN3Q13033 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
STRN3Q13033 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
STRN3Q13033 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
STRN3Q13033 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
STRN3Q13033 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
STRN3Q13033 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
STRN3Q13033 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
STRN3Q13033 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
STRN3Q13033 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
STRN3Q13033 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
STRN3Q13033 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
STRN3Q13033 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
STRN3Q13033 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
STRN3Q13033 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
STRN3Q13033 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
STRN3Q13033 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
STRN3Q13033 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
STRN3Q13033 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
STRN3Q13033 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
STRN3Q13033 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms