Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PRDM2Q13029 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PRDM2Q13029 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PRDM2Q13029 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PRDM2Q13029 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PRDM2Q13029 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
PRDM2Q13029 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
PRDM2Q13029 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PRDM2Q13029 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
PRDM2Q13029 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
PRDM2Q13029 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
PRDM2Q13029 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PRDM2Q13029 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
PRDM2Q13029 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PRDM2Q13029 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PRDM2Q13029 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PRDM2Q13029 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PRDM2Q13029 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PRDM2Q13029 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PRDM2Q13029 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
PRDM2Q13029 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PRDM2Q13029 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PRDM2Q13029 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PRDM2Q13029 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PRDM2Q13029 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
PRDM2Q13029 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PRDM2Q13029 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PRDM2Q13029 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PRDM2Q13029 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PRDM2Q13029 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PRDM2Q13029 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PRDM2Q13029 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PRDM2Q13029 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PRDM2Q13029 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
PRDM2Q13029 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
PRDM2Q13029 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PRDM2Q13029 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PRDM2Q13029 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PRDM2Q13029 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
PRDM2Q13029 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
PRDM2Q13029 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PRDM2Q13029 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PRDM2Q13029 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PRDM2Q13029 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
PRDM2Q13029 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC30.21■■■□□ 2.43
PRDM2Q13029 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
PRDM2Q13029 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
PRDM2Q13029 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
PRDM2Q13029 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
PRDM2Q13029 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PRDM2Q13029 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
PRDM2Q13029 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC30.21■■■□□ 2.43
PRDM2Q13029 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
PRDM2Q13029 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
PRDM2Q13029 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
PRDM2Q13029 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
PRDM2Q13029 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
PRDM2Q13029 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
PRDM2Q13029 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
PRDM2Q13029 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
PRDM2Q13029 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
PRDM2Q13029 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
PRDM2Q13029 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
PRDM2Q13029 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
PRDM2Q13029 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
PRDM2Q13029 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
PRDM2Q13029 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC30.2■■■□□ 2.42
PRDM2Q13029 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC30.2■■■□□ 2.42
PRDM2Q13029 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
PRDM2Q13029 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
PRDM2Q13029 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
PRDM2Q13029 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PRDM2Q13029 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PRDM2Q13029 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PRDM2Q13029 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PRDM2Q13029 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PRDM2Q13029 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PRDM2Q13029 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PRDM2Q13029 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PRDM2Q13029 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PRDM2Q13029 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
PRDM2Q13029 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PRDM2Q13029 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
PRDM2Q13029 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PRDM2Q13029 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PRDM2Q13029 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PRDM2Q13029 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PRDM2Q13029 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PRDM2Q13029 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PRDM2Q13029 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PRDM2Q13029 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PRDM2Q13029 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PRDM2Q13029 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PRDM2Q13029 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PRDM2Q13029 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
PRDM2Q13029 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PRDM2Q13029 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PRDM2Q13029 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PRDM2Q13029 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PRDM2Q13029 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
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