Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NPRL3Q12980 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
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