Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXF2Q12947 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXF2Q12947 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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