Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMAN2Q12907 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
LMAN2Q12907 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMAN2Q12907 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMAN2Q12907 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMAN2Q12907 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMAN2Q12907 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMAN2Q12907 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMAN2Q12907 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMAN2Q12907 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMAN2Q12907 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMAN2Q12907 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMAN2Q12907 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
LMAN2Q12907 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
LMAN2Q12907 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMAN2Q12907 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMAN2Q12907 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
LMAN2Q12907 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMAN2Q12907 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMAN2Q12907 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMAN2Q12907 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMAN2Q12907 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMAN2Q12907 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMAN2Q12907 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMAN2Q12907 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMAN2Q12907 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMAN2Q12907 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMAN2Q12907 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMAN2Q12907 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMAN2Q12907 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMAN2Q12907 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMAN2Q12907 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMAN2Q12907 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMAN2Q12907 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMAN2Q12907 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMAN2Q12907 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LMAN2Q12907 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMAN2Q12907 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMAN2Q12907 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMAN2Q12907 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMAN2Q12907 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMAN2Q12907 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMAN2Q12907 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMAN2Q12907 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMAN2Q12907 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LMAN2Q12907 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMAN2Q12907 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMAN2Q12907 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMAN2Q12907 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMAN2Q12907 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMAN2Q12907 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMAN2Q12907 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMAN2Q12907 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LMAN2Q12907 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LMAN2Q12907 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMAN2Q12907 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LMAN2Q12907 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMAN2Q12907 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMAN2Q12907 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMAN2Q12907 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LMAN2Q12907 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMAN2Q12907 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMAN2Q12907 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMAN2Q12907 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMAN2Q12907 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMAN2Q12907 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMAN2Q12907 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMAN2Q12907 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMAN2Q12907 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMAN2Q12907 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMAN2Q12907 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMAN2Q12907 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMAN2Q12907 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMAN2Q12907 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMAN2Q12907 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMAN2Q12907 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMAN2Q12907 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
LMAN2Q12907 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMAN2Q12907 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMAN2Q12907 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMAN2Q12907 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMAN2Q12907 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMAN2Q12907 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMAN2Q12907 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMAN2Q12907 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMAN2Q12907 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMAN2Q12907 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMAN2Q12907 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMAN2Q12907 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMAN2Q12907 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMAN2Q12907 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
LMAN2Q12907 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMAN2Q12907 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMAN2Q12907 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
LMAN2Q12907 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMAN2Q12907 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMAN2Q12907 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
LMAN2Q12907 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMAN2Q12907 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMAN2Q12907 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.6 ms