Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
APOBRQ0VD83 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
APOBRQ0VD83 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
APOBRQ0VD83 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
APOBRQ0VD83 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
APOBRQ0VD83 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
APOBRQ0VD83 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
APOBRQ0VD83 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
APOBRQ0VD83 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
APOBRQ0VD83 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
APOBRQ0VD83 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
APOBRQ0VD83 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
APOBRQ0VD83 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
APOBRQ0VD83 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
APOBRQ0VD83 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
APOBRQ0VD83 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
APOBRQ0VD83 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
APOBRQ0VD83 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
APOBRQ0VD83 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
APOBRQ0VD83 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
APOBRQ0VD83 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
APOBRQ0VD83 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
APOBRQ0VD83 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
APOBRQ0VD83 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
APOBRQ0VD83 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
APOBRQ0VD83 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
APOBRQ0VD83 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
APOBRQ0VD83 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
APOBRQ0VD83 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
APOBRQ0VD83 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
APOBRQ0VD83 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
APOBRQ0VD83 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
APOBRQ0VD83 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
APOBRQ0VD83 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
APOBRQ0VD83 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
APOBRQ0VD83 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
APOBRQ0VD83 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
APOBRQ0VD83 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
APOBRQ0VD83 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
APOBRQ0VD83 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
APOBRQ0VD83 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
APOBRQ0VD83 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
APOBRQ0VD83 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
APOBRQ0VD83 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
APOBRQ0VD83 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
APOBRQ0VD83 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
APOBRQ0VD83 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
APOBRQ0VD83 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
APOBRQ0VD83 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
APOBRQ0VD83 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
APOBRQ0VD83 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
APOBRQ0VD83 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
APOBRQ0VD83 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
APOBRQ0VD83 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
APOBRQ0VD83 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
APOBRQ0VD83 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
APOBRQ0VD83 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
APOBRQ0VD83 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
APOBRQ0VD83 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
APOBRQ0VD83 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
APOBRQ0VD83 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
APOBRQ0VD83 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
APOBRQ0VD83 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
APOBRQ0VD83 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
APOBRQ0VD83 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
APOBRQ0VD83 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
APOBRQ0VD83 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
APOBRQ0VD83 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
APOBRQ0VD83 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
APOBRQ0VD83 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
APOBRQ0VD83 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
APOBRQ0VD83 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
APOBRQ0VD83 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
APOBRQ0VD83 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
APOBRQ0VD83 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
APOBRQ0VD83 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
APOBRQ0VD83 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
APOBRQ0VD83 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
APOBRQ0VD83 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
APOBRQ0VD83 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
APOBRQ0VD83 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
APOBRQ0VD83 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
APOBRQ0VD83 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
APOBRQ0VD83 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
APOBRQ0VD83 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
APOBRQ0VD83 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
APOBRQ0VD83 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
APOBRQ0VD83 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
APOBRQ0VD83 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
APOBRQ0VD83 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms