Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SSRP1Q08945 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms