Protein–RNA interactions for Protein: Q06889

EGR3, Early growth response protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR3Q06889 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
EGR3Q06889 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms