Protein–RNA interactions for Protein: Q03721

KCNC4, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC4Q03721 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 SERPINA7P1-201ENST00000443077 631 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 AC006213.4-201ENST00000616184 634 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNC4Q03721 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms