Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms