Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms