Protein–RNA interactions for Protein: P98172

EFNB1, Ephrin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB1P98172 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms