Protein–RNA interactions for Protein: P68133

ACTA1, Actin, alpha skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA1P68133 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms