Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTBP60709 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTBP60709 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTBP60709 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTBP60709 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTBP60709 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTBP60709 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTBP60709 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTBP60709 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTBP60709 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTBP60709 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTBP60709 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTBP60709 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTBP60709 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTBP60709 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTBP60709 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTBP60709 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTBP60709 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTBP60709 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTBP60709 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTBP60709 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTBP60709 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTBP60709 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTBP60709 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTBP60709 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTBP60709 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTBP60709 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTBP60709 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTBP60709 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTBP60709 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTBP60709 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTBP60709 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTBP60709 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTBP60709 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTBP60709 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTBP60709 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTBP60709 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTBP60709 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTBP60709 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTBP60709 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTBP60709 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTBP60709 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTBP60709 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTBP60709 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTBP60709 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTBP60709 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTBP60709 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTBP60709 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTBP60709 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTBP60709 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTBP60709 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTBP60709 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTBP60709 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTBP60709 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTBP60709 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTBP60709 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTBP60709 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTBP60709 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTBP60709 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTBP60709 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTBP60709 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTBP60709 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTBP60709 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTBP60709 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTBP60709 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTBP60709 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTBP60709 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTBP60709 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTBP60709 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTBP60709 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTBP60709 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTBP60709 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTBP60709 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTBP60709 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTBP60709 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTBP60709 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTBP60709 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTBP60709 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTBP60709 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTBP60709 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTBP60709 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTBP60709 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTBP60709 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTBP60709 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTBP60709 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTBP60709 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTBP60709 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTBP60709 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTBP60709 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTBP60709 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTBP60709 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTBP60709 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTBP60709 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTBP60709 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTBP60709 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTBP60709 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTBP60709 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTBP60709 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTBP60709 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTBP60709 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms