Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPC1P35052 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPC1P35052 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPC1P35052 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPC1P35052 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPC1P35052 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPC1P35052 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPC1P35052 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPC1P35052 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPC1P35052 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPC1P35052 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPC1P35052 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GPC1P35052 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GPC1P35052 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GPC1P35052 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GPC1P35052 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GPC1P35052 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GPC1P35052 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GPC1P35052 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GPC1P35052 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GPC1P35052 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GPC1P35052 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GPC1P35052 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GPC1P35052 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GPC1P35052 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
GPC1P35052 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GPC1P35052 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GPC1P35052 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GPC1P35052 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GPC1P35052 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GPC1P35052 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
GPC1P35052 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GPC1P35052 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GPC1P35052 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GPC1P35052 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GPC1P35052 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GPC1P35052 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GPC1P35052 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GPC1P35052 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GPC1P35052 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GPC1P35052 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GPC1P35052 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GPC1P35052 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GPC1P35052 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GPC1P35052 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GPC1P35052 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GPC1P35052 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
GPC1P35052 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GPC1P35052 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
GPC1P35052 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GPC1P35052 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GPC1P35052 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GPC1P35052 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GPC1P35052 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GPC1P35052 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GPC1P35052 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GPC1P35052 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GPC1P35052 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GPC1P35052 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GPC1P35052 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GPC1P35052 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GPC1P35052 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GPC1P35052 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GPC1P35052 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
GPC1P35052 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
GPC1P35052 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GPC1P35052 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GPC1P35052 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GPC1P35052 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
GPC1P35052 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GPC1P35052 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GPC1P35052 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GPC1P35052 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GPC1P35052 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GPC1P35052 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GPC1P35052 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GPC1P35052 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GPC1P35052 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GPC1P35052 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GPC1P35052 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GPC1P35052 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GPC1P35052 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GPC1P35052 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GPC1P35052 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GPC1P35052 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GPC1P35052 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GPC1P35052 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GPC1P35052 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GPC1P35052 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GPC1P35052 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GPC1P35052 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GPC1P35052 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GPC1P35052 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GPC1P35052 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GPC1P35052 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GPC1P35052 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GPC1P35052 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GPC1P35052 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GPC1P35052 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GPC1P35052 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms