Protein–RNA interactions for Protein: P31327

CPS1, Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1P31327 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CPS1P31327 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CPS1P31327 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CPS1P31327 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CPS1P31327 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CPS1P31327 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CPS1P31327 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CPS1P31327 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CPS1P31327 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CPS1P31327 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CPS1P31327 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CPS1P31327 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CPS1P31327 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CPS1P31327 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CPS1P31327 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CPS1P31327 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CPS1P31327 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CPS1P31327 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CPS1P31327 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CPS1P31327 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CPS1P31327 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CPS1P31327 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CPS1P31327 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CPS1P31327 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CPS1P31327 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CPS1P31327 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CPS1P31327 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CPS1P31327 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CPS1P31327 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CPS1P31327 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CPS1P31327 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CPS1P31327 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CPS1P31327 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CPS1P31327 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CPS1P31327 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CPS1P31327 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CPS1P31327 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CPS1P31327 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CPS1P31327 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CPS1P31327 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CPS1P31327 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CPS1P31327 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CPS1P31327 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CPS1P31327 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CPS1P31327 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CPS1P31327 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CPS1P31327 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CPS1P31327 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CPS1P31327 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CPS1P31327 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CPS1P31327 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CPS1P31327 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CPS1P31327 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CPS1P31327 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CPS1P31327 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CPS1P31327 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CPS1P31327 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CPS1P31327 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CPS1P31327 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CPS1P31327 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CPS1P31327 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CPS1P31327 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CPS1P31327 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CPS1P31327 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CPS1P31327 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CPS1P31327 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CPS1P31327 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CPS1P31327 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CPS1P31327 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CPS1P31327 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CPS1P31327 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CPS1P31327 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CPS1P31327 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CPS1P31327 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CPS1P31327 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CPS1P31327 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CPS1P31327 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CPS1P31327 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CPS1P31327 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CPS1P31327 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CPS1P31327 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CPS1P31327 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CPS1P31327 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CPS1P31327 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CPS1P31327 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CPS1P31327 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CPS1P31327 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CPS1P31327 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CPS1P31327 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CPS1P31327 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CPS1P31327 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CPS1P31327 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CPS1P31327 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CPS1P31327 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CPS1P31327 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CPS1P31327 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CPS1P31327 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CPS1P31327 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CPS1P31327 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CPS1P31327 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms