Protein–RNA interactions for Protein: P28906

CD34, Hematopoietic progenitor cell antigen CD34, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD34P28906 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD34P28906 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD34P28906 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD34P28906 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD34P28906 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD34P28906 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CD34P28906 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD34P28906 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD34P28906 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD34P28906 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD34P28906 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD34P28906 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD34P28906 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD34P28906 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD34P28906 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD34P28906 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD34P28906 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD34P28906 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD34P28906 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD34P28906 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD34P28906 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD34P28906 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD34P28906 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD34P28906 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD34P28906 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD34P28906 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CD34P28906 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD34P28906 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD34P28906 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD34P28906 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD34P28906 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD34P28906 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD34P28906 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD34P28906 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD34P28906 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CD34P28906 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CD34P28906 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD34P28906 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD34P28906 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD34P28906 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD34P28906 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD34P28906 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD34P28906 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD34P28906 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CD34P28906 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD34P28906 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD34P28906 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD34P28906 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD34P28906 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD34P28906 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD34P28906 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD34P28906 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD34P28906 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD34P28906 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD34P28906 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD34P28906 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD34P28906 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD34P28906 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD34P28906 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD34P28906 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD34P28906 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CD34P28906 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD34P28906 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD34P28906 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD34P28906 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD34P28906 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD34P28906 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD34P28906 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD34P28906 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD34P28906 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD34P28906 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD34P28906 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD34P28906 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CD34P28906 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CD34P28906 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD34P28906 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD34P28906 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD34P28906 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD34P28906 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD34P28906 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD34P28906 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD34P28906 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD34P28906 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD34P28906 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD34P28906 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD34P28906 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD34P28906 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD34P28906 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD34P28906 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
CD34P28906 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CD34P28906 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CD34P28906 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CD34P28906 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CD34P28906 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CD34P28906 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CD34P28906 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
CD34P28906 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CD34P28906 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD34P28906 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD34P28906 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms