Protein–RNA interactions for Protein: P28300

LOX, Protein-lysine 6-oxidase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXP28300 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LOXP28300 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LOXP28300 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LOXP28300 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LOXP28300 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LOXP28300 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LOXP28300 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LOXP28300 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LOXP28300 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LOXP28300 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LOXP28300 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LOXP28300 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LOXP28300 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LOXP28300 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LOXP28300 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LOXP28300 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LOXP28300 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LOXP28300 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LOXP28300 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LOXP28300 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LOXP28300 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LOXP28300 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LOXP28300 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LOXP28300 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LOXP28300 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LOXP28300 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LOXP28300 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LOXP28300 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LOXP28300 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LOXP28300 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LOXP28300 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LOXP28300 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LOXP28300 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LOXP28300 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LOXP28300 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LOXP28300 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LOXP28300 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LOXP28300 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LOXP28300 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LOXP28300 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LOXP28300 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LOXP28300 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LOXP28300 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LOXP28300 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LOXP28300 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LOXP28300 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LOXP28300 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LOXP28300 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LOXP28300 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LOXP28300 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LOXP28300 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LOXP28300 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LOXP28300 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LOXP28300 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LOXP28300 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LOXP28300 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LOXP28300 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LOXP28300 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LOXP28300 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LOXP28300 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LOXP28300 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LOXP28300 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LOXP28300 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LOXP28300 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LOXP28300 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LOXP28300 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LOXP28300 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LOXP28300 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LOXP28300 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LOXP28300 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LOXP28300 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LOXP28300 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LOXP28300 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LOXP28300 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LOXP28300 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LOXP28300 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LOXP28300 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LOXP28300 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LOXP28300 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LOXP28300 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LOXP28300 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LOXP28300 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LOXP28300 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LOXP28300 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LOXP28300 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LOXP28300 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LOXP28300 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LOXP28300 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LOXP28300 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LOXP28300 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LOXP28300 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LOXP28300 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LOXP28300 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LOXP28300 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LOXP28300 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LOXP28300 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LOXP28300 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LOXP28300 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LOXP28300 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LOXP28300 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms