Protein–RNA interactions for Protein: P24522

GADD45A, Growth arrest and DNA damage-inducible protein GADD45 alpha, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45AP24522 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GADD45AP24522 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GADD45AP24522 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GADD45AP24522 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GADD45AP24522 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GADD45AP24522 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GADD45AP24522 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GADD45AP24522 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GADD45AP24522 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GADD45AP24522 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GADD45AP24522 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GADD45AP24522 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GADD45AP24522 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GADD45AP24522 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GADD45AP24522 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GADD45AP24522 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GADD45AP24522 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GADD45AP24522 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GADD45AP24522 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GADD45AP24522 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GADD45AP24522 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GADD45AP24522 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GADD45AP24522 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GADD45AP24522 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GADD45AP24522 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GADD45AP24522 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GADD45AP24522 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GADD45AP24522 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GADD45AP24522 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GADD45AP24522 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GADD45AP24522 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GADD45AP24522 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GADD45AP24522 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GADD45AP24522 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GADD45AP24522 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GADD45AP24522 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GADD45AP24522 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GADD45AP24522 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GADD45AP24522 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GADD45AP24522 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GADD45AP24522 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GADD45AP24522 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GADD45AP24522 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GADD45AP24522 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GADD45AP24522 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GADD45AP24522 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GADD45AP24522 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GADD45AP24522 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GADD45AP24522 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GADD45AP24522 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GADD45AP24522 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GADD45AP24522 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GADD45AP24522 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GADD45AP24522 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GADD45AP24522 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GADD45AP24522 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GADD45AP24522 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GADD45AP24522 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GADD45AP24522 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GADD45AP24522 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GADD45AP24522 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GADD45AP24522 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GADD45AP24522 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GADD45AP24522 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GADD45AP24522 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GADD45AP24522 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GADD45AP24522 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GADD45AP24522 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GADD45AP24522 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GADD45AP24522 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GADD45AP24522 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GADD45AP24522 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GADD45AP24522 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GADD45AP24522 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GADD45AP24522 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GADD45AP24522 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GADD45AP24522 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GADD45AP24522 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GADD45AP24522 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GADD45AP24522 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GADD45AP24522 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GADD45AP24522 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GADD45AP24522 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GADD45AP24522 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GADD45AP24522 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GADD45AP24522 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GADD45AP24522 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GADD45AP24522 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GADD45AP24522 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GADD45AP24522 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GADD45AP24522 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GADD45AP24522 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GADD45AP24522 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GADD45AP24522 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GADD45AP24522 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GADD45AP24522 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GADD45AP24522 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GADD45AP24522 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GADD45AP24522 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GADD45AP24522 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms