Protein–RNA interactions for Protein: P23510

TNFSF4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF4P23510 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TNFSF4P23510 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms