Protein–RNA interactions for Protein: P22362

CCL1, C-C motif chemokine 1, humanhuman

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL1P22362 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL1P22362 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL1P22362 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL1P22362 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL1P22362 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL1P22362 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL1P22362 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL1P22362 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL1P22362 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL1P22362 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL1P22362 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL1P22362 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL1P22362 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL1P22362 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL1P22362 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL1P22362 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL1P22362 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL1P22362 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL1P22362 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL1P22362 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL1P22362 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL1P22362 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL1P22362 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL1P22362 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL1P22362 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL1P22362 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL1P22362 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL1P22362 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL1P22362 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL1P22362 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL1P22362 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL1P22362 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL1P22362 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL1P22362 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL1P22362 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL1P22362 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL1P22362 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL1P22362 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL1P22362 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL1P22362 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL1P22362 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL1P22362 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL1P22362 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL1P22362 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL1P22362 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL1P22362 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL1P22362 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL1P22362 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL1P22362 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL1P22362 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL1P22362 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL1P22362 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL1P22362 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL1P22362 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL1P22362 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL1P22362 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL1P22362 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL1P22362 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL1P22362 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL1P22362 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL1P22362 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL1P22362 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL1P22362 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL1P22362 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL1P22362 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL1P22362 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL1P22362 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL1P22362 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL1P22362 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL1P22362 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL1P22362 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL1P22362 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL1P22362 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL1P22362 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL1P22362 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL1P22362 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL1P22362 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL1P22362 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL1P22362 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL1P22362 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL1P22362 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL1P22362 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL1P22362 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL1P22362 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL1P22362 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL1P22362 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL1P22362 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL1P22362 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL1P22362 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL1P22362 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL1P22362 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL1P22362 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL1P22362 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL1P22362 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL1P22362 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL1P22362 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL1P22362 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL1P22362 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL1P22362 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL1P22362 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms