Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CREB1P16220 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CREB1P16220 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CREB1P16220 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CREB1P16220 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CREB1P16220 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CREB1P16220 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CREB1P16220 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CREB1P16220 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CREB1P16220 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CREB1P16220 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CREB1P16220 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CREB1P16220 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CREB1P16220 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CREB1P16220 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CREB1P16220 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CREB1P16220 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CREB1P16220 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CREB1P16220 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CREB1P16220 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CREB1P16220 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CREB1P16220 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CREB1P16220 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CREB1P16220 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CREB1P16220 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CREB1P16220 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CREB1P16220 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CREB1P16220 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CREB1P16220 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CREB1P16220 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CREB1P16220 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CREB1P16220 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CREB1P16220 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CREB1P16220 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CREB1P16220 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CREB1P16220 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CREB1P16220 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CREB1P16220 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CREB1P16220 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CREB1P16220 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CREB1P16220 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CREB1P16220 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CREB1P16220 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CREB1P16220 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CREB1P16220 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CREB1P16220 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CREB1P16220 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CREB1P16220 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CREB1P16220 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CREB1P16220 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CREB1P16220 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CREB1P16220 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CREB1P16220 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CREB1P16220 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CREB1P16220 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CREB1P16220 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CREB1P16220 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CREB1P16220 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CREB1P16220 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CREB1P16220 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CREB1P16220 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CREB1P16220 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CREB1P16220 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CREB1P16220 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CREB1P16220 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CREB1P16220 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CREB1P16220 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CREB1P16220 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CREB1P16220 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CREB1P16220 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CREB1P16220 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CREB1P16220 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CREB1P16220 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CREB1P16220 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CREB1P16220 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CREB1P16220 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CREB1P16220 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CREB1P16220 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CREB1P16220 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CREB1P16220 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CREB1P16220 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CREB1P16220 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CREB1P16220 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CREB1P16220 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CREB1P16220 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CREB1P16220 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CREB1P16220 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CREB1P16220 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CREB1P16220 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CREB1P16220 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CREB1P16220 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CREB1P16220 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CREB1P16220 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CREB1P16220 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CREB1P16220 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CREB1P16220 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CREB1P16220 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CREB1P16220 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CREB1P16220 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CREB1P16220 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms