Protein–RNA interactions for Protein: P14373

TRIM27, Zinc finger protein RFP, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM27P14373 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM27P14373 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM27P14373 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM27P14373 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM27P14373 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM27P14373 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM27P14373 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM27P14373 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM27P14373 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM27P14373 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM27P14373 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM27P14373 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM27P14373 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM27P14373 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM27P14373 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM27P14373 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM27P14373 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM27P14373 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM27P14373 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM27P14373 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM27P14373 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM27P14373 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM27P14373 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM27P14373 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM27P14373 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM27P14373 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM27P14373 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM27P14373 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM27P14373 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM27P14373 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM27P14373 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM27P14373 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM27P14373 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM27P14373 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM27P14373 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM27P14373 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM27P14373 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM27P14373 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM27P14373 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM27P14373 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM27P14373 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM27P14373 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM27P14373 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM27P14373 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM27P14373 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM27P14373 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM27P14373 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM27P14373 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM27P14373 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM27P14373 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM27P14373 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM27P14373 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM27P14373 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM27P14373 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM27P14373 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM27P14373 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM27P14373 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM27P14373 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM27P14373 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM27P14373 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM27P14373 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM27P14373 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM27P14373 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TRIM27P14373 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TRIM27P14373 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
TRIM27P14373 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM27P14373 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM27P14373 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM27P14373 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM27P14373 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM27P14373 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM27P14373 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM27P14373 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM27P14373 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM27P14373 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM27P14373 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM27P14373 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM27P14373 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM27P14373 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM27P14373 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM27P14373 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM27P14373 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM27P14373 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM27P14373 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM27P14373 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM27P14373 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM27P14373 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM27P14373 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM27P14373 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM27P14373 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM27P14373 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM27P14373 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM27P14373 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM27P14373 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM27P14373 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM27P14373 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM27P14373 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM27P14373 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM27P14373 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM27P14373 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms