Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GLI3P10071 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GLI3P10071 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GLI3P10071 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GLI3P10071 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
GLI3P10071 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GLI3P10071 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GLI3P10071 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
GLI3P10071 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GLI3P10071 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GLI3P10071 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
GLI3P10071 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GLI3P10071 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GLI3P10071 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GLI3P10071 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GLI3P10071 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GLI3P10071 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GLI3P10071 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GLI3P10071 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GLI3P10071 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GLI3P10071 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
GLI3P10071 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GLI3P10071 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GLI3P10071 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GLI3P10071 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GLI3P10071 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
GLI3P10071 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GLI3P10071 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GLI3P10071 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
GLI3P10071 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GLI3P10071 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GLI3P10071 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GLI3P10071 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GLI3P10071 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GLI3P10071 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GLI3P10071 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GLI3P10071 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GLI3P10071 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GLI3P10071 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GLI3P10071 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
GLI3P10071 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GLI3P10071 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GLI3P10071 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GLI3P10071 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GLI3P10071 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GLI3P10071 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GLI3P10071 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GLI3P10071 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GLI3P10071 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GLI3P10071 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GLI3P10071 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GLI3P10071 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GLI3P10071 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GLI3P10071 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GLI3P10071 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GLI3P10071 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GLI3P10071 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GLI3P10071 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GLI3P10071 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GLI3P10071 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GLI3P10071 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
GLI3P10071 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GLI3P10071 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GLI3P10071 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GLI3P10071 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GLI3P10071 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GLI3P10071 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GLI3P10071 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GLI3P10071 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GLI3P10071 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GLI3P10071 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GLI3P10071 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GLI3P10071 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GLI3P10071 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GLI3P10071 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GLI3P10071 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GLI3P10071 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GLI3P10071 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GLI3P10071 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GLI3P10071 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GLI3P10071 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GLI3P10071 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GLI3P10071 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GLI3P10071 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GLI3P10071 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GLI3P10071 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GLI3P10071 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GLI3P10071 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GLI3P10071 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GLI3P10071 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
GLI3P10071 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GLI3P10071 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GLI3P10071 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
GLI3P10071 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
GLI3P10071 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GLI3P10071 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
GLI3P10071 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GLI3P10071 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
GLI3P10071 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GLI3P10071 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms