Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
CCDC192P0DO97 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC192P0DO97 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC192P0DO97 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC192P0DO97 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC192P0DO97 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC192P0DO97 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC192P0DO97 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC192P0DO97 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC192P0DO97 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC192P0DO97 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC192P0DO97 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC192P0DO97 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC192P0DO97 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC192P0DO97 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC192P0DO97 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC192P0DO97 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC192P0DO97 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC192P0DO97 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC192P0DO97 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC192P0DO97 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC192P0DO97 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC192P0DO97 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC192P0DO97 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC192P0DO97 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC192P0DO97 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC192P0DO97 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC192P0DO97 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms