Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C4BP0C0L5 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C4BP0C0L5 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C4BP0C0L5 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C4BP0C0L5 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C4BP0C0L5 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C4BP0C0L5 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C4BP0C0L5 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C4BP0C0L5 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C4BP0C0L5 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C4BP0C0L5 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C4BP0C0L5 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
C4BP0C0L5 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C4BP0C0L5 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C4BP0C0L5 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C4BP0C0L5 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C4BP0C0L5 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C4BP0C0L5 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C4BP0C0L5 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C4BP0C0L5 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C4BP0C0L5 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
C4BP0C0L5 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C4BP0C0L5 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C4BP0C0L5 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C4BP0C0L5 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C4BP0C0L5 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C4BP0C0L5 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C4BP0C0L5 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C4BP0C0L5 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C4BP0C0L5 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C4BP0C0L5 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C4BP0C0L5 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C4BP0C0L5 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C4BP0C0L5 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C4BP0C0L5 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
C4BP0C0L5 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C4BP0C0L5 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C4BP0C0L5 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C4BP0C0L5 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
C4BP0C0L5 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C4BP0C0L5 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
C4BP0C0L5 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C4BP0C0L5 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C4BP0C0L5 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
C4BP0C0L5 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C4BP0C0L5 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C4BP0C0L5 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C4BP0C0L5 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C4BP0C0L5 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C4BP0C0L5 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
C4BP0C0L5 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C4BP0C0L5 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C4BP0C0L5 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C4BP0C0L5 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C4BP0C0L5 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C4BP0C0L5 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C4BP0C0L5 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C4BP0C0L5 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
C4BP0C0L5 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C4BP0C0L5 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C4BP0C0L5 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C4BP0C0L5 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C4BP0C0L5 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C4BP0C0L5 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C4BP0C0L5 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
C4BP0C0L5 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C4BP0C0L5 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C4BP0C0L5 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C4BP0C0L5 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C4BP0C0L5 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C4BP0C0L5 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C4BP0C0L5 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C4BP0C0L5 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C4BP0C0L5 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C4BP0C0L5 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C4BP0C0L5 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C4BP0C0L5 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C4BP0C0L5 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C4BP0C0L5 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C4BP0C0L5 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C4BP0C0L5 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C4BP0C0L5 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C4BP0C0L5 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C4BP0C0L5 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C4BP0C0L5 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C4BP0C0L5 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
C4BP0C0L5 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C4BP0C0L5 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C4BP0C0L5 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C4BP0C0L5 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C4BP0C0L5 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C4BP0C0L5 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C4BP0C0L5 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C4BP0C0L5 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C4BP0C0L5 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C4BP0C0L5 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C4BP0C0L5 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C4BP0C0L5 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C4BP0C0L5 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C4BP0C0L5 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
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