Protein–RNA interactions for Protein: P09238

MMP10, Stromelysin-2, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP10P09238 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MMP10P09238 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MMP10P09238 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MMP10P09238 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MMP10P09238 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MMP10P09238 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MMP10P09238 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MMP10P09238 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MMP10P09238 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MMP10P09238 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MMP10P09238 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MMP10P09238 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MMP10P09238 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MMP10P09238 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MMP10P09238 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MMP10P09238 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MMP10P09238 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MMP10P09238 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MMP10P09238 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MMP10P09238 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MMP10P09238 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MMP10P09238 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MMP10P09238 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MMP10P09238 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MMP10P09238 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MMP10P09238 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MMP10P09238 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MMP10P09238 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MMP10P09238 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MMP10P09238 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MMP10P09238 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MMP10P09238 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MMP10P09238 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MMP10P09238 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MMP10P09238 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MMP10P09238 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MMP10P09238 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MMP10P09238 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MMP10P09238 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MMP10P09238 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MMP10P09238 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MMP10P09238 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MMP10P09238 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MMP10P09238 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MMP10P09238 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MMP10P09238 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MMP10P09238 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MMP10P09238 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MMP10P09238 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MMP10P09238 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MMP10P09238 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MMP10P09238 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MMP10P09238 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MMP10P09238 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MMP10P09238 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MMP10P09238 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MMP10P09238 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MMP10P09238 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MMP10P09238 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MMP10P09238 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MMP10P09238 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MMP10P09238 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MMP10P09238 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MMP10P09238 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MMP10P09238 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MMP10P09238 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MMP10P09238 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MMP10P09238 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MMP10P09238 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MMP10P09238 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MMP10P09238 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MMP10P09238 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MMP10P09238 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MMP10P09238 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MMP10P09238 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MMP10P09238 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MMP10P09238 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MMP10P09238 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MMP10P09238 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MMP10P09238 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MMP10P09238 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MMP10P09238 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MMP10P09238 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MMP10P09238 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MMP10P09238 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MMP10P09238 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MMP10P09238 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MMP10P09238 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MMP10P09238 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MMP10P09238 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MMP10P09238 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MMP10P09238 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MMP10P09238 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MMP10P09238 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MMP10P09238 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MMP10P09238 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MMP10P09238 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MMP10P09238 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MMP10P09238 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MMP10P09238 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms