Protein–RNA interactions for Protein: P07766

CD3E, T-cell surface glycoprotein CD3 epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD3EP07766 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD3EP07766 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD3EP07766 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CD3EP07766 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD3EP07766 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD3EP07766 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD3EP07766 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD3EP07766 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD3EP07766 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD3EP07766 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD3EP07766 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD3EP07766 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD3EP07766 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD3EP07766 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD3EP07766 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD3EP07766 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD3EP07766 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD3EP07766 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD3EP07766 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD3EP07766 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CD3EP07766 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD3EP07766 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD3EP07766 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD3EP07766 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD3EP07766 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD3EP07766 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD3EP07766 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD3EP07766 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CD3EP07766 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD3EP07766 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD3EP07766 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD3EP07766 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD3EP07766 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD3EP07766 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD3EP07766 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD3EP07766 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD3EP07766 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD3EP07766 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD3EP07766 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD3EP07766 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD3EP07766 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD3EP07766 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD3EP07766 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD3EP07766 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD3EP07766 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD3EP07766 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD3EP07766 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD3EP07766 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD3EP07766 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD3EP07766 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CD3EP07766 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD3EP07766 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD3EP07766 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD3EP07766 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD3EP07766 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD3EP07766 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD3EP07766 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD3EP07766 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD3EP07766 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD3EP07766 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD3EP07766 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD3EP07766 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD3EP07766 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD3EP07766 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD3EP07766 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CD3EP07766 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD3EP07766 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD3EP07766 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD3EP07766 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CD3EP07766 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD3EP07766 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD3EP07766 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD3EP07766 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD3EP07766 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD3EP07766 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD3EP07766 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD3EP07766 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD3EP07766 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD3EP07766 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD3EP07766 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD3EP07766 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD3EP07766 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD3EP07766 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD3EP07766 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD3EP07766 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD3EP07766 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD3EP07766 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD3EP07766 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD3EP07766 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD3EP07766 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD3EP07766 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD3EP07766 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD3EP07766 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD3EP07766 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD3EP07766 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD3EP07766 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD3EP07766 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD3EP07766 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD3EP07766 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD3EP07766 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms