Protein–RNA interactions for Protein: O95471

CLDN7, Claudin-7, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN7O95471 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLDN7O95471 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLDN7O95471 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CLDN7O95471 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLDN7O95471 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLDN7O95471 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLDN7O95471 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLDN7O95471 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLDN7O95471 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLDN7O95471 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLDN7O95471 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLDN7O95471 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLDN7O95471 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLDN7O95471 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLDN7O95471 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CLDN7O95471 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLDN7O95471 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLDN7O95471 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLDN7O95471 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLDN7O95471 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CLDN7O95471 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLDN7O95471 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLDN7O95471 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLDN7O95471 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CLDN7O95471 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLDN7O95471 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLDN7O95471 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLDN7O95471 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLDN7O95471 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLDN7O95471 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLDN7O95471 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLDN7O95471 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLDN7O95471 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLDN7O95471 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLDN7O95471 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLDN7O95471 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLDN7O95471 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLDN7O95471 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLDN7O95471 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLDN7O95471 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLDN7O95471 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLDN7O95471 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLDN7O95471 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLDN7O95471 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLDN7O95471 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLDN7O95471 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLDN7O95471 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CLDN7O95471 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLDN7O95471 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLDN7O95471 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLDN7O95471 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CLDN7O95471 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLDN7O95471 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLDN7O95471 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLDN7O95471 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLDN7O95471 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLDN7O95471 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLDN7O95471 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLDN7O95471 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLDN7O95471 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLDN7O95471 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLDN7O95471 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLDN7O95471 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLDN7O95471 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLDN7O95471 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CLDN7O95471 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CLDN7O95471 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CLDN7O95471 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CLDN7O95471 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CLDN7O95471 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLDN7O95471 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLDN7O95471 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLDN7O95471 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLDN7O95471 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLDN7O95471 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CLDN7O95471 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLDN7O95471 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLDN7O95471 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLDN7O95471 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLDN7O95471 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLDN7O95471 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLDN7O95471 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLDN7O95471 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLDN7O95471 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CLDN7O95471 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLDN7O95471 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLDN7O95471 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLDN7O95471 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CLDN7O95471 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLDN7O95471 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLDN7O95471 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLDN7O95471 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLDN7O95471 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLDN7O95471 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLDN7O95471 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLDN7O95471 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLDN7O95471 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLDN7O95471 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLDN7O95471 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLDN7O95471 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms