Protein–RNA interactions for Protein: O95236

APOL3, Apolipoprotein L3, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL3O95236 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOL3O95236 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
APOL3O95236 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOL3O95236 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOL3O95236 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
APOL3O95236 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOL3O95236 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOL3O95236 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOL3O95236 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOL3O95236 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOL3O95236 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
APOL3O95236 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOL3O95236 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOL3O95236 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOL3O95236 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
APOL3O95236 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
APOL3O95236 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOL3O95236 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOL3O95236 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
APOL3O95236 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
APOL3O95236 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOL3O95236 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOL3O95236 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOL3O95236 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOL3O95236 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOL3O95236 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOL3O95236 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOL3O95236 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOL3O95236 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOL3O95236 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOL3O95236 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOL3O95236 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOL3O95236 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOL3O95236 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOL3O95236 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOL3O95236 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOL3O95236 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOL3O95236 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOL3O95236 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOL3O95236 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOL3O95236 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOL3O95236 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOL3O95236 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOL3O95236 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOL3O95236 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOL3O95236 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOL3O95236 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOL3O95236 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOL3O95236 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOL3O95236 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOL3O95236 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOL3O95236 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOL3O95236 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOL3O95236 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
APOL3O95236 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOL3O95236 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOL3O95236 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOL3O95236 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOL3O95236 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
APOL3O95236 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOL3O95236 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOL3O95236 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOL3O95236 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOL3O95236 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOL3O95236 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
APOL3O95236 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOL3O95236 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOL3O95236 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOL3O95236 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOL3O95236 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOL3O95236 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOL3O95236 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOL3O95236 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOL3O95236 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOL3O95236 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOL3O95236 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOL3O95236 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOL3O95236 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOL3O95236 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOL3O95236 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOL3O95236 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOL3O95236 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
APOL3O95236 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOL3O95236 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOL3O95236 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOL3O95236 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOL3O95236 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOL3O95236 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOL3O95236 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOL3O95236 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOL3O95236 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOL3O95236 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOL3O95236 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOL3O95236 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOL3O95236 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOL3O95236 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOL3O95236 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOL3O95236 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOL3O95236 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOL3O95236 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms