Protein–RNA interactions for Protein: O95166

GABARAP, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPO95166 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABARAPO95166 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABARAPO95166 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABARAPO95166 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABARAPO95166 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABARAPO95166 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GABARAPO95166 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABARAPO95166 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABARAPO95166 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABARAPO95166 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABARAPO95166 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABARAPO95166 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABARAPO95166 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABARAPO95166 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABARAPO95166 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABARAPO95166 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABARAPO95166 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABARAPO95166 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABARAPO95166 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GABARAPO95166 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABARAPO95166 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABARAPO95166 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABARAPO95166 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABARAPO95166 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABARAPO95166 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABARAPO95166 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABARAPO95166 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABARAPO95166 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABARAPO95166 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABARAPO95166 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABARAPO95166 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABARAPO95166 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABARAPO95166 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABARAPO95166 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABARAPO95166 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABARAPO95166 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABARAPO95166 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABARAPO95166 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABARAPO95166 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABARAPO95166 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABARAPO95166 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABARAPO95166 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABARAPO95166 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABARAPO95166 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABARAPO95166 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABARAPO95166 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GABARAPO95166 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABARAPO95166 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GABARAPO95166 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABARAPO95166 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABARAPO95166 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABARAPO95166 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABARAPO95166 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABARAPO95166 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABARAPO95166 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABARAPO95166 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABARAPO95166 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABARAPO95166 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABARAPO95166 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABARAPO95166 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABARAPO95166 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GABARAPO95166 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABARAPO95166 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABARAPO95166 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABARAPO95166 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABARAPO95166 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABARAPO95166 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABARAPO95166 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABARAPO95166 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABARAPO95166 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABARAPO95166 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABARAPO95166 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABARAPO95166 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABARAPO95166 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABARAPO95166 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABARAPO95166 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABARAPO95166 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GABARAPO95166 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABARAPO95166 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABARAPO95166 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABARAPO95166 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABARAPO95166 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABARAPO95166 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABARAPO95166 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABARAPO95166 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABARAPO95166 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABARAPO95166 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABARAPO95166 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GABARAPO95166 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABARAPO95166 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABARAPO95166 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABARAPO95166 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABARAPO95166 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABARAPO95166 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABARAPO95166 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms