Protein–RNA interactions for Protein: O94966

USP19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP19O94966 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP19O94966 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP19O94966 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP19O94966 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP19O94966 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP19O94966 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP19O94966 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP19O94966 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP19O94966 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP19O94966 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
USP19O94966 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
USP19O94966 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
USP19O94966 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
USP19O94966 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
USP19O94966 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
USP19O94966 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
USP19O94966 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
USP19O94966 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
USP19O94966 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
USP19O94966 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
USP19O94966 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
USP19O94966 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
USP19O94966 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP19O94966 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP19O94966 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
USP19O94966 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP19O94966 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP19O94966 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP19O94966 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP19O94966 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP19O94966 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP19O94966 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP19O94966 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
USP19O94966 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP19O94966 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP19O94966 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
USP19O94966 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP19O94966 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
USP19O94966 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
USP19O94966 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP19O94966 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP19O94966 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP19O94966 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP19O94966 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP19O94966 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
USP19O94966 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP19O94966 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP19O94966 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP19O94966 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP19O94966 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP19O94966 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP19O94966 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP19O94966 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP19O94966 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP19O94966 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
USP19O94966 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP19O94966 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP19O94966 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
USP19O94966 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP19O94966 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP19O94966 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP19O94966 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP19O94966 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP19O94966 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP19O94966 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP19O94966 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP19O94966 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP19O94966 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP19O94966 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP19O94966 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP19O94966 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP19O94966 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP19O94966 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP19O94966 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP19O94966 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP19O94966 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP19O94966 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP19O94966 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP19O94966 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP19O94966 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP19O94966 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP19O94966 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP19O94966 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP19O94966 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP19O94966 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP19O94966 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP19O94966 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP19O94966 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP19O94966 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP19O94966 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP19O94966 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP19O94966 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP19O94966 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP19O94966 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP19O94966 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP19O94966 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP19O94966 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP19O94966 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP19O94966 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP19O94966 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
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