Protein–RNA interactions for Protein: O75923

DYSF, Dysferlin, humanhuman

Predictions only

Length 2,080 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DYSFO75923 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DYSFO75923 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DYSFO75923 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
DYSFO75923 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DYSFO75923 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DYSFO75923 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.08■□□□□ 0
DYSFO75923 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DYSFO75923 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DYSFO75923 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DYSFO75923 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DYSFO75923 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DYSFO75923 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DYSFO75923 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DYSFO75923 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DYSFO75923 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DYSFO75923 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DYSFO75923 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DYSFO75923 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC15.08■□□□□ 0
DYSFO75923 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DYSFO75923 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DYSFO75923 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DYSFO75923 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DYSFO75923 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DYSFO75923 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DYSFO75923 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DYSFO75923 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DYSFO75923 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DYSFO75923 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DYSFO75923 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DYSFO75923 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DYSFO75923 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
DYSFO75923 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
DYSFO75923 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DYSFO75923 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DYSFO75923 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.07■□□□□ 0
DYSFO75923 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DYSFO75923 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DYSFO75923 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DYSFO75923 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DYSFO75923 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DYSFO75923 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DYSFO75923 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DYSFO75923 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DYSFO75923 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DYSFO75923 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DYSFO75923 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DYSFO75923 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DYSFO75923 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DYSFO75923 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DYSFO75923 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DYSFO75923 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
DYSFO75923 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DYSFO75923 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DYSFO75923 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DYSFO75923 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DYSFO75923 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DYSFO75923 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DYSFO75923 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DYSFO75923 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DYSFO75923 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DYSFO75923 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DYSFO75923 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DYSFO75923 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DYSFO75923 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DYSFO75923 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DYSFO75923 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DYSFO75923 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DYSFO75923 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DYSFO75923 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DYSFO75923 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DYSFO75923 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DYSFO75923 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15.06■□□□□ 0
DYSFO75923 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DYSFO75923 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DYSFO75923 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DYSFO75923 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DYSFO75923 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DYSFO75923 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DYSFO75923 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DYSFO75923 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
DYSFO75923 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DYSFO75923 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.06■□□□□ 0
DYSFO75923 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DYSFO75923 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DYSFO75923 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
DYSFO75923 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DYSFO75923 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
DYSFO75923 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DYSFO75923 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DYSFO75923 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DYSFO75923 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DYSFO75923 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DYSFO75923 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DYSFO75923 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DYSFO75923 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC15.06■□□□□ 0
DYSFO75923 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DYSFO75923 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DYSFO75923 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DYSFO75923 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DYSFO75923 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms